La demarcació de Girona es troba al capdavant en matèria de conservació del territori a través de la custòdia, una fórmula que permet conservar la natura, el paisatge i el patrimoni cultural amb la implicació directa i activa de la societat civil, les administracions i els propietaris. L'any 2009 es van comptabilitzar 157 acords de custòdia, un 36% del total a Catalunya, a càrrec de 17 entitats de custòdia amb més de 74.900 hectàrees, segons dades de la Xarxa de Custòdia del Territori. Aquesta superfície representa el 40% del total d'hectàrees custodiades a Catalunya. Entre els espais protegits, hi ha la vall de Sant Daniel de Girona o les Gavarres, entre d'altres.

Des de la xarxa, destaquen la rapidesa amb què s'està estenent aquesta fórmula de custòdia i posen l'exemple de la Fundació Emys, que ha aconseguit tancar 12 acords, i el Consorci de l'Alta Garrotxa, amb un total de deu en només dos anys. Els àmbits on es desenvolupa la custòdia són diversos, des de la custòdia marina de Nereo passant pels nous projectes de custòdia agrària impulsada per la IAEDEN a l'Alt Empordà.

El president del Consell d'Iniciatives Locals per al Medi Ambient de les Comarques Gironines (CILMA), Lluís Lloret, assenyala que una gran part dels espais naturals gironins han trobat "fórmules exitoses" de conservació i restauració de la biodiversitat, gràcies a les iniciatives del teixit social i associatiu i el compromís creixent dels polítics locals que aposten per tenir cura d'aquest llegat.

Alguns exemples

Entre els projectes que actualment hi ha vigents a la demarcació, hi ha la del Centre d'Educació Ambiental Alt Ter de preservació del Molí Petit de Sant Joan de les Abadesses; la protecció del prat de dalt del veïnat d'Esclet de Cassà de la Selva; els acords entre l'Ajuntament de Girona i els propietaris de la vall de Sant Daniel per recuperar la biodiversitat; la tasca de Galanthus en la custòdia d'hàbitats d'interès a les Gavarres, gestionant la flora invasora; el programa de custòdia per al manteniment del connector d'Aiguaviva com a garantia ecològica dut a terme per La Copa; i els projectes de custòdia en els municipis del litoral del Baix Empordà impulsats per Nereo.